Protein–RNA interactions for Protein: H7C1W4

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1W4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
H7C1W4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
H7C1W4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
H7C1W4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
H7C1W4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
H7C1W4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
H7C1W4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
H7C1W4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
H7C1W4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
H7C1W4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
H7C1W4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
H7C1W4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
H7C1W4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
H7C1W4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
H7C1W4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
H7C1W4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
H7C1W4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
H7C1W4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
H7C1W4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
H7C1W4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
H7C1W4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
H7C1W4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
H7C1W4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
H7C1W4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
H7C1W4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
H7C1W4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
H7C1W4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
H7C1W4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
H7C1W4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
H7C1W4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
H7C1W4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
H7C1W4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
H7C1W4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
H7C1W4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
H7C1W4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
H7C1W4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
H7C1W4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
H7C1W4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
H7C1W4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
H7C1W4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
H7C1W4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
H7C1W4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
H7C1W4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
H7C1W4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
H7C1W4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
H7C1W4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
H7C1W4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
H7C1W4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
H7C1W4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
H7C1W4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
H7C1W4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
H7C1W4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
H7C1W4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
H7C1W4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
H7C1W4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
H7C1W4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
H7C1W4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
H7C1W4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
H7C1W4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
H7C1W4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
H7C1W4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
H7C1W4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
H7C1W4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
H7C1W4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
H7C1W4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
H7C1W4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
H7C1W4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
H7C1W4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
H7C1W4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
H7C1W4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
H7C1W4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
H7C1W4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
H7C1W4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
H7C1W4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
H7C1W4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
H7C1W4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
H7C1W4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
H7C1W4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
H7C1W4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
H7C1W4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
H7C1W4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
H7C1W4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
H7C1W4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
H7C1W4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
H7C1W4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
H7C1W4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
H7C1W4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
H7C1W4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
H7C1W4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
H7C1W4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
H7C1W4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
H7C1W4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
H7C1W4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
H7C1W4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
H7C1W4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
H7C1W4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
H7C1W4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
H7C1W4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
H7C1W4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
H7C1W4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms