Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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