Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3B5MD39 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
GGTLC3B5MD39 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GGTLC3B5MD39 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
GGTLC3B5MD39 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GGTLC3B5MD39 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GGTLC3B5MD39 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GGTLC3B5MD39 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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