Protein–RNA interactions for Protein: B2RC85

RSPH10B2, Radial spoke head 10 homolog B2, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH10B2B2RC85 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RSPH10B2B2RC85 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RSPH10B2B2RC85 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms