Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NOTOA8MTQ0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms