Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZNF316A6NFI3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZNF316A6NFI3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZNF316A6NFI3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZNF316A6NFI3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZNF316A6NFI3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZNF316A6NFI3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZNF316A6NFI3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ZNF316A6NFI3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ZNF316A6NFI3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ZNF316A6NFI3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ZNF316A6NFI3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ZNF316A6NFI3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ZNF316A6NFI3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ZNF316A6NFI3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ZNF316A6NFI3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ZNF316A6NFI3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ZNF316A6NFI3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ZNF316A6NFI3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ZNF316A6NFI3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ZNF316A6NFI3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ZNF316A6NFI3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ZNF316A6NFI3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
ZNF316A6NFI3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ZNF316A6NFI3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
ZNF316A6NFI3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ZNF316A6NFI3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ZNF316A6NFI3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ZNF316A6NFI3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ZNF316A6NFI3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ZNF316A6NFI3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZNF316A6NFI3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZNF316A6NFI3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZNF316A6NFI3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZNF316A6NFI3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZNF316A6NFI3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZNF316A6NFI3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZNF316A6NFI3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZNF316A6NFI3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZNF316A6NFI3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
ZNF316A6NFI3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZNF316A6NFI3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZNF316A6NFI3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZNF316A6NFI3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZNF316A6NFI3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZNF316A6NFI3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
ZNF316A6NFI3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZNF316A6NFI3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZNF316A6NFI3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZNF316A6NFI3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZNF316A6NFI3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZNF316A6NFI3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZNF316A6NFI3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZNF316A6NFI3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZNF316A6NFI3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZNF316A6NFI3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZNF316A6NFI3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZNF316A6NFI3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZNF316A6NFI3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZNF316A6NFI3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZNF316A6NFI3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZNF316A6NFI3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZNF316A6NFI3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZNF316A6NFI3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZNF316A6NFI3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZNF316A6NFI3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ZNF316A6NFI3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ZNF316A6NFI3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
ZNF316A6NFI3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ZNF316A6NFI3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ZNF316A6NFI3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ZNF316A6NFI3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ZNF316A6NFI3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
ZNF316A6NFI3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ZNF316A6NFI3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ZNF316A6NFI3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ZNF316A6NFI3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ZNF316A6NFI3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ZNF316A6NFI3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ZNF316A6NFI3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ZNF316A6NFI3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ZNF316A6NFI3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ZNF316A6NFI3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ZNF316A6NFI3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ZNF316A6NFI3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ZNF316A6NFI3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ZNF316A6NFI3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ZNF316A6NFI3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ZNF316A6NFI3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ZNF316A6NFI3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
ZNF316A6NFI3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
ZNF316A6NFI3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
ZNF316A6NFI3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
ZNF316A6NFI3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ZNF316A6NFI3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ZNF316A6NFI3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ZNF316A6NFI3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ZNF316A6NFI3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ZNF316A6NFI3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ZNF316A6NFI3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.3 ms