Protein–RNA interactions for Protein: A5A3E0

POTEF, POTE ankyrin domain family member F, humanhuman

Predictions only

Length 1,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEFA5A3E0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms