Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYCE3A1L190 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SYCE3A1L190 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYCE3A1L190 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SYCE3A1L190 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SYCE3A1L190 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SYCE3A1L190 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SYCE3A1L190 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYCE3A1L190 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYCE3A1L190 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYCE3A1L190 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYCE3A1L190 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYCE3A1L190 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYCE3A1L190 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYCE3A1L190 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYCE3A1L190 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYCE3A1L190 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYCE3A1L190 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYCE3A1L190 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYCE3A1L190 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCE3A1L190 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCE3A1L190 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCE3A1L190 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCE3A1L190 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCE3A1L190 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCE3A1L190 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCE3A1L190 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCE3A1L190 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCE3A1L190 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCE3A1L190 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCE3A1L190 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCE3A1L190 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCE3A1L190 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCE3A1L190 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCE3A1L190 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCE3A1L190 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCE3A1L190 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCE3A1L190 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCE3A1L190 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCE3A1L190 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCE3A1L190 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCE3A1L190 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCE3A1L190 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCE3A1L190 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCE3A1L190 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCE3A1L190 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYCE3A1L190 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms