Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQJ8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQJ8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0U1RQJ8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms