Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms