Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y1

CAMTA1, Calmodulin-binding transcription activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1Q9Y6Y1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CAMTA1Q9Y6Y1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CAMTA1Q9Y6Y1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CAMTA1Q9Y6Y1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CAMTA1Q9Y6Y1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CAMTA1Q9Y6Y1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CAMTA1Q9Y6Y1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CAMTA1Q9Y6Y1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CAMTA1Q9Y6Y1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CAMTA1Q9Y6Y1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CAMTA1Q9Y6Y1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CAMTA1Q9Y6Y1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CAMTA1Q9Y6Y1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CAMTA1Q9Y6Y1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CAMTA1Q9Y6Y1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CAMTA1Q9Y6Y1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CAMTA1Q9Y6Y1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CAMTA1Q9Y6Y1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CAMTA1Q9Y6Y1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CAMTA1Q9Y6Y1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
CAMTA1Q9Y6Y1 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms