Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms