Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y543

HES2, Transcription factor HES-2, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES2Q9Y543 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HES2Q9Y543 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HES2Q9Y543 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HES2Q9Y543 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HES2Q9Y543 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HES2Q9Y543 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HES2Q9Y543 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HES2Q9Y543 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HES2Q9Y543 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HES2Q9Y543 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HES2Q9Y543 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HES2Q9Y543 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HES2Q9Y543 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HES2Q9Y543 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HES2Q9Y543 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HES2Q9Y543 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HES2Q9Y543 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HES2Q9Y543 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HES2Q9Y543 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HES2Q9Y543 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HES2Q9Y543 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms