Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP15Q9Y4E8 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP15Q9Y4E8 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP15Q9Y4E8 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP15Q9Y4E8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP15Q9Y4E8 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
USP15Q9Y4E8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP15Q9Y4E8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP15Q9Y4E8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP15Q9Y4E8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP15Q9Y4E8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP15Q9Y4E8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP15Q9Y4E8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
USP15Q9Y4E8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP15Q9Y4E8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP15Q9Y4E8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP15Q9Y4E8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP15Q9Y4E8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP15Q9Y4E8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP15Q9Y4E8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP15Q9Y4E8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP15Q9Y4E8 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
USP15Q9Y4E8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP15Q9Y4E8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP15Q9Y4E8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP15Q9Y4E8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP15Q9Y4E8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP15Q9Y4E8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP15Q9Y4E8 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP15Q9Y4E8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP15Q9Y4E8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP15Q9Y4E8 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
USP15Q9Y4E8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP15Q9Y4E8 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP15Q9Y4E8 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP15Q9Y4E8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP15Q9Y4E8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP15Q9Y4E8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP15Q9Y4E8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP15Q9Y4E8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP15Q9Y4E8 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP15Q9Y4E8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP15Q9Y4E8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
USP15Q9Y4E8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
USP15Q9Y4E8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
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