Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NUDCQ9Y266 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NUDCQ9Y266 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NUDCQ9Y266 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NUDCQ9Y266 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NUDCQ9Y266 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NUDCQ9Y266 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NUDCQ9Y266 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NUDCQ9Y266 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NUDCQ9Y266 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
NUDCQ9Y266 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
NUDCQ9Y266 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NUDCQ9Y266 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NUDCQ9Y266 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NUDCQ9Y266 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NUDCQ9Y266 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NUDCQ9Y266 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NUDCQ9Y266 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NUDCQ9Y266 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NUDCQ9Y266 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NUDCQ9Y266 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NUDCQ9Y266 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NUDCQ9Y266 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NUDCQ9Y266 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NUDCQ9Y266 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NUDCQ9Y266 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NUDCQ9Y266 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NUDCQ9Y266 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NUDCQ9Y266 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NUDCQ9Y266 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NUDCQ9Y266 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NUDCQ9Y266 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUDCQ9Y266 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUDCQ9Y266 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUDCQ9Y266 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUDCQ9Y266 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUDCQ9Y266 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
NUDCQ9Y266 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUDCQ9Y266 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUDCQ9Y266 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUDCQ9Y266 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUDCQ9Y266 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUDCQ9Y266 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUDCQ9Y266 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NUDCQ9Y266 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NUDCQ9Y266 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
NUDCQ9Y266 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NUDCQ9Y266 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NUDCQ9Y266 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NUDCQ9Y266 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NUDCQ9Y266 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NUDCQ9Y266 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NUDCQ9Y266 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NUDCQ9Y266 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NUDCQ9Y266 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NUDCQ9Y266 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NUDCQ9Y266 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NUDCQ9Y266 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NUDCQ9Y266 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
NUDCQ9Y266 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NUDCQ9Y266 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NUDCQ9Y266 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NUDCQ9Y266 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NUDCQ9Y266 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NUDCQ9Y266 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NUDCQ9Y266 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NUDCQ9Y266 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NUDCQ9Y266 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NUDCQ9Y266 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NUDCQ9Y266 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NUDCQ9Y266 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NUDCQ9Y266 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NUDCQ9Y266 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
NUDCQ9Y266 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NUDCQ9Y266 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NUDCQ9Y266 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NUDCQ9Y266 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NUDCQ9Y266 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NUDCQ9Y266 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NUDCQ9Y266 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NUDCQ9Y266 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NUDCQ9Y266 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
NUDCQ9Y266 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
NUDCQ9Y266 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NUDCQ9Y266 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NUDCQ9Y266 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NUDCQ9Y266 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NUDCQ9Y266 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NUDCQ9Y266 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NUDCQ9Y266 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NUDCQ9Y266 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NUDCQ9Y266 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NUDCQ9Y266 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NUDCQ9Y266 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NUDCQ9Y266 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NUDCQ9Y266 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NUDCQ9Y266 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NUDCQ9Y266 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NUDCQ9Y266 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
NUDCQ9Y266 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms