Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y239

NOD1, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD1Q9Y239 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms