Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTNND2Q9UQB3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms