Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SHOC2Q9UQ13 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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