Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX6

KIAA1024, UPF0258 protein KIAA1024, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1024Q9UPX6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KIAA1024Q9UPX6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KIAA1024Q9UPX6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KIAA1024Q9UPX6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
KIAA1024Q9UPX6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIAA1024Q9UPX6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIAA1024Q9UPX6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIAA1024Q9UPX6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIAA1024Q9UPX6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIAA1024Q9UPX6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIAA1024Q9UPX6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIAA1024Q9UPX6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIAA1024Q9UPX6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KIAA1024Q9UPX6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIAA1024Q9UPX6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIAA1024Q9UPX6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIAA1024Q9UPX6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIAA1024Q9UPX6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIAA1024Q9UPX6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIAA1024Q9UPX6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIAA1024Q9UPX6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms