Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMG5Q9UPR3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms