Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AGAP1Q9UPQ3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms