Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM19

HPCAL4, Hippocalcin-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAL4Q9UM19 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HPCAL4Q9UM19 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HPCAL4Q9UM19 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HPCAL4Q9UM19 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HPCAL4Q9UM19 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HPCAL4Q9UM19 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HPCAL4Q9UM19 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HPCAL4Q9UM19 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPCAL4Q9UM19 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPCAL4Q9UM19 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPCAL4Q9UM19 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPCAL4Q9UM19 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPCAL4Q9UM19 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPCAL4Q9UM19 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPCAL4Q9UM19 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPCAL4Q9UM19 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPCAL4Q9UM19 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPCAL4Q9UM19 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPCAL4Q9UM19 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPCAL4Q9UM19 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPCAL4Q9UM19 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HPCAL4Q9UM19 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPCAL4Q9UM19 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms