Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC2LQ9UL33 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms