Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJX2

CDC23, Cell division cycle protein 23 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC23Q9UJX2 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC23Q9UJX2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC23Q9UJX2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC23Q9UJX2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC23Q9UJX2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC23Q9UJX2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC23Q9UJX2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC23Q9UJX2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC23Q9UJX2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC23Q9UJX2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC23Q9UJX2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC23Q9UJX2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC23Q9UJX2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC23Q9UJX2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC23Q9UJX2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC23Q9UJX2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC23Q9UJX2 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC23Q9UJX2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC23Q9UJX2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC23Q9UJX2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC23Q9UJX2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC23Q9UJX2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC23Q9UJX2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC23Q9UJX2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC23Q9UJX2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC23Q9UJX2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC23Q9UJX2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC23Q9UJX2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC23Q9UJX2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC23Q9UJX2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC23Q9UJX2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC23Q9UJX2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC23Q9UJX2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC23Q9UJX2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC23Q9UJX2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC23Q9UJX2 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC23Q9UJX2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC23Q9UJX2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC23Q9UJX2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC23Q9UJX2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC23Q9UJX2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC23Q9UJX2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC23Q9UJX2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC23Q9UJX2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC23Q9UJX2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC23Q9UJX2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC23Q9UJX2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC23Q9UJX2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC23Q9UJX2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC23Q9UJX2 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC23Q9UJX2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC23Q9UJX2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC23Q9UJX2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC23Q9UJX2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC23Q9UJX2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC23Q9UJX2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms