Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RABGEF1Q9UJ41 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RABGEF1Q9UJ41 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RABGEF1Q9UJ41 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RABGEF1Q9UJ41 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RABGEF1Q9UJ41 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RABGEF1Q9UJ41 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RABGEF1Q9UJ41 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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RABGEF1Q9UJ41 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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RABGEF1Q9UJ41 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
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RABGEF1Q9UJ41 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
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