Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CYTH4Q9UIA0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms