Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFMBT1Q9UHJ3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms