Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HMGXB4Q9UGU5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms