Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU0

TCF20, Transcription factor 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF20Q9UGU0 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TCF20Q9UGU0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TCF20Q9UGU0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms