Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCF2Q9UG63 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCF2Q9UG63 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCF2Q9UG63 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCF2Q9UG63 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCF2Q9UG63 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCF2Q9UG63 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCF2Q9UG63 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCF2Q9UG63 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCF2Q9UG63 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCF2Q9UG63 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCF2Q9UG63 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCF2Q9UG63 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCF2Q9UG63 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCF2Q9UG63 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCF2Q9UG63 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCF2Q9UG63 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCF2Q9UG63 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCF2Q9UG63 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCF2Q9UG63 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCF2Q9UG63 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCF2Q9UG63 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCF2Q9UG63 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCF2Q9UG63 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCF2Q9UG63 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCF2Q9UG63 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCF2Q9UG63 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCF2Q9UG63 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCF2Q9UG63 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCF2Q9UG63 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCF2Q9UG63 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCF2Q9UG63 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCF2Q9UG63 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCF2Q9UG63 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCF2Q9UG63 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCF2Q9UG63 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCF2Q9UG63 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCF2Q9UG63 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCF2Q9UG63 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCF2Q9UG63 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCF2Q9UG63 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCF2Q9UG63 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCF2Q9UG63 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCF2Q9UG63 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCF2Q9UG63 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCF2Q9UG63 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCF2Q9UG63 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCF2Q9UG63 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCF2Q9UG63 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCF2Q9UG63 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCF2Q9UG63 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCF2Q9UG63 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCF2Q9UG63 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCF2Q9UG63 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCF2Q9UG63 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCF2Q9UG63 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCF2Q9UG63 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCF2Q9UG63 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCF2Q9UG63 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCF2Q9UG63 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCF2Q9UG63 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCF2Q9UG63 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCF2Q9UG63 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCF2Q9UG63 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCF2Q9UG63 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCF2Q9UG63 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCF2Q9UG63 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCF2Q9UG63 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCF2Q9UG63 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCF2Q9UG63 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCF2Q9UG63 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCF2Q9UG63 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCF2Q9UG63 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ABCF2Q9UG63 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ABCF2Q9UG63 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ABCF2Q9UG63 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ABCF2Q9UG63 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ABCF2Q9UG63 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ABCF2Q9UG63 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCF2Q9UG63 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms