Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU9

NXF1, Nuclear RNA export factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF1Q9UBU9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms