Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC9

SPRR3, Small proline-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR3Q9UBC9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPRR3Q9UBC9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPRR3Q9UBC9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPRR3Q9UBC9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPRR3Q9UBC9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPRR3Q9UBC9 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPRR3Q9UBC9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPRR3Q9UBC9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPRR3Q9UBC9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPRR3Q9UBC9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPRR3Q9UBC9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPRR3Q9UBC9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SPRR3Q9UBC9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SPRR3Q9UBC9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPRR3Q9UBC9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms