Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL9Q9P2J3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 306.3 ms