Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGSF9Q9P2J2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms