Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms