Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALCOCO1Q9P1Z2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms