Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY59

SMPD3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD3Q9NY59 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMPD3Q9NY59 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms