Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL28Q9NXS3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL28Q9NXS3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms