Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE4

SMPD4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD4Q9NXE4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMPD4Q9NXE4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMPD4Q9NXE4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMPD4Q9NXE4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMPD4Q9NXE4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SMPD4Q9NXE4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SMPD4Q9NXE4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SMPD4Q9NXE4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMPD4Q9NXE4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SMPD4Q9NXE4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMPD4Q9NXE4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SMPD4Q9NXE4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMPD4Q9NXE4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMPD4Q9NXE4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMPD4Q9NXE4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMPD4Q9NXE4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMPD4Q9NXE4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMPD4Q9NXE4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SMPD4Q9NXE4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMPD4Q9NXE4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMPD4Q9NXE4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMPD4Q9NXE4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMPD4Q9NXE4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMPD4Q9NXE4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMPD4Q9NXE4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMPD4Q9NXE4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMPD4Q9NXE4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMPD4Q9NXE4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMPD4Q9NXE4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMPD4Q9NXE4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMPD4Q9NXE4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMPD4Q9NXE4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMPD4Q9NXE4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMPD4Q9NXE4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMPD4Q9NXE4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMPD4Q9NXE4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMPD4Q9NXE4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMPD4Q9NXE4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMPD4Q9NXE4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMPD4Q9NXE4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMPD4Q9NXE4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SMPD4Q9NXE4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMPD4Q9NXE4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMPD4Q9NXE4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMPD4Q9NXE4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMPD4Q9NXE4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMPD4Q9NXE4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMPD4Q9NXE4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMPD4Q9NXE4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMPD4Q9NXE4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMPD4Q9NXE4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMPD4Q9NXE4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMPD4Q9NXE4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMPD4Q9NXE4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMPD4Q9NXE4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMPD4Q9NXE4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMPD4Q9NXE4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMPD4Q9NXE4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
SMPD4Q9NXE4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SMPD4Q9NXE4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SMPD4Q9NXE4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SMPD4Q9NXE4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMPD4Q9NXE4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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