Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
COMMD8Q9NX08 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
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