Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1orf109Q9NX04 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1orf109Q9NX04 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1orf109Q9NX04 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1orf109Q9NX04 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1orf109Q9NX04 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1orf109Q9NX04 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1orf109Q9NX04 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1orf109Q9NX04 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1orf109Q9NX04 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1orf109Q9NX04 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1orf109Q9NX04 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1orf109Q9NX04 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
C1orf109Q9NX04 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1orf109Q9NX04 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1orf109Q9NX04 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf109Q9NX04 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf109Q9NX04 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf109Q9NX04 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf109Q9NX04 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf109Q9NX04 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf109Q9NX04 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf109Q9NX04 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf109Q9NX04 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf109Q9NX04 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf109Q9NX04 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf109Q9NX04 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf109Q9NX04 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf109Q9NX04 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf109Q9NX04 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf109Q9NX04 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf109Q9NX04 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf109Q9NX04 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C1orf109Q9NX04 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C1orf109Q9NX04 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C1orf109Q9NX04 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C1orf109Q9NX04 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C1orf109Q9NX04 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C1orf109Q9NX04 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C1orf109Q9NX04 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C1orf109Q9NX04 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C1orf109Q9NX04 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
C1orf109Q9NX04 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C1orf109Q9NX04 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C1orf109Q9NX04 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms