Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IFT57Q9NWB7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.96
IFT57Q9NWB7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
IFT57Q9NWB7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
IFT57Q9NWB7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IFT57Q9NWB7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
IFT57Q9NWB7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
IFT57Q9NWB7 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
IFT57Q9NWB7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
IFT57Q9NWB7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
IFT57Q9NWB7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
IFT57Q9NWB7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IFT57Q9NWB7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IFT57Q9NWB7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
IFT57Q9NWB7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IFT57Q9NWB7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IFT57Q9NWB7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IFT57Q9NWB7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IFT57Q9NWB7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
IFT57Q9NWB7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
IFT57Q9NWB7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IFT57Q9NWB7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
IFT57Q9NWB7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IFT57Q9NWB7 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
IFT57Q9NWB7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IFT57Q9NWB7 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms