Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATAD3AQ9NVI7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms