Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms