Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC6A13Q9NSD5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms