Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT82Q9NSB4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT82Q9NSB4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms