Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TOPORSQ9NS56 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms