Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNNM1Q9NRU3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNNM1Q9NRU3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNNM1Q9NRU3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNNM1Q9NRU3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNNM1Q9NRU3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CNNM1Q9NRU3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNNM1Q9NRU3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNNM1Q9NRU3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNNM1Q9NRU3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNNM1Q9NRU3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNNM1Q9NRU3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNNM1Q9NRU3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNNM1Q9NRU3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNNM1Q9NRU3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNNM1Q9NRU3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNNM1Q9NRU3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNNM1Q9NRU3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNNM1Q9NRU3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
CNNM1Q9NRU3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNNM1Q9NRU3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNNM1Q9NRU3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNNM1Q9NRU3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNNM1Q9NRU3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNNM1Q9NRU3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNNM1Q9NRU3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNNM1Q9NRU3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNNM1Q9NRU3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNNM1Q9NRU3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNNM1Q9NRU3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CNNM1Q9NRU3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNNM1Q9NRU3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNNM1Q9NRU3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CNNM1Q9NRU3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CNNM1Q9NRU3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CNNM1Q9NRU3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CNNM1Q9NRU3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CNNM1Q9NRU3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CNNM1Q9NRU3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CNNM1Q9NRU3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CNNM1Q9NRU3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CNNM1Q9NRU3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CNNM1Q9NRU3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CNNM1Q9NRU3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CNNM1Q9NRU3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CNNM1Q9NRU3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CNNM1Q9NRU3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CNNM1Q9NRU3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CNNM1Q9NRU3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNNM1Q9NRU3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNNM1Q9NRU3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNNM1Q9NRU3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNNM1Q9NRU3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNNM1Q9NRU3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNNM1Q9NRU3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNNM1Q9NRU3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNNM1Q9NRU3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNNM1Q9NRU3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNNM1Q9NRU3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNNM1Q9NRU3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNNM1Q9NRU3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNNM1Q9NRU3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNNM1Q9NRU3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNNM1Q9NRU3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNNM1Q9NRU3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNNM1Q9NRU3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNNM1Q9NRU3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNNM1Q9NRU3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CNNM1Q9NRU3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNNM1Q9NRU3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNNM1Q9NRU3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNNM1Q9NRU3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNNM1Q9NRU3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNNM1Q9NRU3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNNM1Q9NRU3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNNM1Q9NRU3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNNM1Q9NRU3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNNM1Q9NRU3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNNM1Q9NRU3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNNM1Q9NRU3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNNM1Q9NRU3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNNM1Q9NRU3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNNM1Q9NRU3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNNM1Q9NRU3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNNM1Q9NRU3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNNM1Q9NRU3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNNM1Q9NRU3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNNM1Q9NRU3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNNM1Q9NRU3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CNNM1Q9NRU3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNNM1Q9NRU3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNNM1Q9NRU3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNNM1Q9NRU3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNNM1Q9NRU3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
CNNM1Q9NRU3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CNNM1Q9NRU3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CNNM1Q9NRU3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CNNM1Q9NRU3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNNM1Q9NRU3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms