Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQY0

BIN3, Bridging integrator 3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN3Q9NQY0 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BIN3Q9NQY0 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms