Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms